Abstract
Objective
PTC-specific analysis identified novel fusions involving RET, BRAF, NTRK1, NTRK3, AGK and ALK genes in adults and pediatric PTCs. Although many novel fusions are PTC-specific events and, therefore, are ideal for diagnosis purposes, validation across additional and larger patient cohorts is essential for introducing these potential diagnostic or prognostic biomarkers into the clinical practice. As most of the BRAF, NTRK3 and ALK fusions were initially found in pediatric PTC or in more aggressive thyroid carcinomas, and there is a great disparity across population, in this study, we screened a large set of adult-sporadic PTC cases for the most prevalent kinase fusion lately described in the TCGA.
Design and methods
The prevalence of the fusions was determined by RT-PCR in 71 classical PTC, 45 follicular variants of PTC (FVPTC), 19 follicular thyroid adenomas (FTAs) and 22 follicular thyroid carcinomas (FTCs).
Results
ETV6–NTRK3 was exclusively found in FVPTC, in both encapsulated and infiltrative variants, but was not found in FTAs and FTCs. STRN-ALK was found in both classical PTC and FVPTC. No AGK-BRAF fusion was identified in this series, endorsing that AGK–BRAF is a genetic event mainly associated with pediatric PTCs.
Conclusions
The identification of kinase fusions in thyroid carcinomas helps to expand our knowledge about the landscape of oncogenic alterations in PTC. As ETV6–NTRK3 and STRN–ALK are recurrent and not identified in benign lesions, they can certainly help with diagnosis of thyroid nodules. Further analysis is needed to define if they can also be useful for prognosis and guiding therapy.
Tradução
Objetivo
A análise do PTC-specific identificou novas fusões envolvendo os genes RET, BRAF, NTRK1, NTRK3, AGK e ALK em adultos e crianças com PTC. Embora muitas novas fusões sejam eventos específicos do PTC e, portanto, ideais para fins de diagnóstico, a validação em coortes adicionais e maiores de pacientes é essencial para introduzir esses potenciais biomarcadores diagnósticos ou prognósticos na prática clínica. Como a maioria das fusões BRAF, NTRK3 e ALK foi inicialmente encontrada em PTC pediátricos ou em carcinomas da tiróide mais agressivos, e há uma grande disparidade entre as populações, neste estudo, analisámos um grande conjunto de casos de PTC esporádicos em adultos para identificar a fusão de quinase mais prevalente descrita recentemente no TCGA.
Design e Metodologia
A prevalência das fusões foi determinada por RT-PCR em 71 PTC clássicos, 45 variantes foliculares de PTC (FVPTC), 19 adenomas foliculares da tiróide (FTAs) e 22 carcinomas foliculares da tireoide (FTCs).
Resultados
ETV6–NTRK3 foi encontrado exclusivamente em FVPTC, tanto na variante encapsulada quanto na infiltrativa, mas não foi encontrado em FTAs e FTCs. STRN-ALK foi encontrado tanto no PTC clássico quanto no FVPTC. Nenhuma fusão AGK-BRAF foi identificada nesta série, confirmando que AGK–BRAF é um evento genético associado principalmente a PTCs pediátricos.
Conclusão
A identificação de fusões de quinase em carcinomas da tireoide ajuda a expandir o nosso conhecimento sobre o panorama das alterações oncogénicas no PTC. Como ETV6–NTRK3 e STRN–ALK são recorrentes e não são identificadas em lesões benignas, elas podem certamente ajudar no diagnóstico de nódulos da tireoide. São necessárias análises adicionais para definir se elas também podem ser úteis para o prognóstico e para orientar a terapia.